菱属（Trapa）植物是我国传统的药食两用水生作物，具有重要的生态和经济价值。菱属植物果壳含有丰富的多酚类物质，具有较强的抗癌和抗氧化作用。本研究选取菱属7个代表性物种，包括1个栽培种南湖菱（T. acornis Nakano）和6个野生种：细果野菱（T. maximowiczii Korsh.）、四角菱（T. quadrispinosa Roxb.）、菱（T. bispinosa Roxb.）、东北菱（T. manshurica Flerow）、科热夫尼科夫菱（T. kozhevnikovirum Pshennikova）和丘角菱（T. japonica Flerow），利用超高效液相色谱串联质谱（UPLC-MS/MS）技术，对其果壳提取物进行广靶向次生代谢产物谱测定，分析其次生代谢产物的物种差异；同时基于叶绿体全基因组构建系统发育树，对菱属7个物种的果壳次生代谢产物及其亲缘关系的相关性进行研究。结果显示：7个物种的果壳提取物中共检测到273种代谢成分，不同物种果壳次生代谢产物谱差异显著，物种内部显示出较高的一致性；不同物种次生代谢产物的热聚类图与叶绿体全基因组构建的分子系统发育树基本吻合，说明菱属物种间亲缘关系越近，其果壳中的次生代谢物成分和含量越相近。